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新型DNA扫描技术能更快诊断癌症和罕见疾病

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发表于 2020-12-12 20:35:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
了解人类 DNA序列可以为科学家提供有关疾病的信息,包括可能的诊断和治疗方法。在《自然生物技术》期刊上的一篇新论文中,该大学生命科学学院的科学家们指出,现在人们可以比以前更快、更经济地选择 DNA片段序列,而无需寻找与 DNA无关的 DNA链。生物题,得到答案的速度比以前快了。

在遗传病的诊断方法上具有重要意义。
该项目由DeepSeq大学生命科学学院MattLoose教授负责,该教授是DeepSeq测序仪器的负责人。""简而言之,我们现在可以对我们想要的DNA序列进行序列分析,而忽略不需要的序列。这个进展意味着我们可以在像人类基因组这么大的区域内搜索基因组序列,甚至测序。

最近的研究显示,该团队现在能够快速扫描人类基因组,利用MinION型便携式DNA测序仪检测基因异常。研究者们通过在15小时内定位导致某种癌症的DNA来证实这一点。人类基因组数据达30亿份,典型的全基因组分析将花费数天时间。因此,该团队表明,该方法现在可用于快速扫描基因组,以确定是否存在明显的问题,而无需对整个基因组进行测序,也无需执行复杂的实验室程序来选择感兴趣的基因组区域。

该团队开发了一种称为 ReadFish的新的选择性方法,这种方法允许 DNA测序仪只选择人类基因组(或任何基因组)的某些区域,从而只对这些区域进行一次序列测定。
罗斯教授继续说:这项突破将使我们可以研究各种应用,例如快速搜索人类基因组片段,寻找可能导致癌症等疾病发生变化的基因状况或证据,这些变化会严重影响癌症的解析。

我们首次看到有人用这种方法来找出许多不同个人的疾病的根源。
该研究的主要作者 AlexanderPayne说:随着实验的进行,真正的适应性排序已经出现了,它提供了许多机会来定制和调整你所遇到的问题,很期待 ReadFish在纳米孔领域的应用。
OxfordNanopore的首席执行官GordonSanghera,是一家实时、便携式测序技术制造商,他说:Matt实验室及其团队AlexanderPayne利用实时测序技术,在人类感兴趣的许多特定区域智能地放大基因组。这项工作的潜在影响可以更快地解决设备的小型化、低成本和易用性问题。该报告充分说明了我们已达到的任何货物分析目标,不论在什么地方。

这项最新的研究成果是该小组于2016年发表的研究成果的基础,并首次展示了高选择性测序的新技术。利用纳米孔实时测序技术,首次实现了对 DNA链中含有特定靶点特征的分析。

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2018年,该团队领导一个国际联盟,通过牛津纳米孔技术公司的手持口袋型 MinION便携式 DNA测序仪,对整个人类基因组进行排序。此时,需要在便携式定序器上运行40多个独立序列。从那时起,这项技术有了长足的进步。


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