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DNA甲基化是DNA胞嘧啶碱基的一种化学修饰，具有特殊的遗传功能，因此被称为“第五碱基”。DNA甲基化在多个生理过程中有重要的作用，如X染色体失活、基因表达调控、基因印记以及维持染色体稳定性等。在正常人类的基因组DNA中，有2%-7%的胞嘧啶被甲基化。研究表明，基因组DNA甲基化水平的异常与很多疾病密切相关，比如肿瘤，心血管疾病、糖尿病及自身免疫疾病等，因此甲基化的检测会为这些疾病的检测和治疗提供非常有用的信息。目前，得益于高通量测序技术的发展，DNA甲基化在临床检测上的应用越来越受到关注。
全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）是DNA甲基化检测的金标准，可在全基因组范围内对甲基化进行精准检测。WGBS测序的原理是用重亚硫酸盐（BS）处理DNA样本，能够将DNA中未甲基化的胞嘧啶（C）转变为尿嘧啶（U），进而通过PCR转变为胸腺嘧啶（T）；而原本甲基化的胞嘧啶（C）则保持不变，从而有效的将DNA修饰的差异转换为序列差异。
过去，BS转化效率高，实验操作较为简便，被广泛采用。但是，随着甲基化研究应用的深入，对于甲基化文库质量也提出了更高的要求，BS转化的弊端也逐渐显现：其激烈的反应会对DNA造成有偏好性的损伤，造成检测的偏好性。
例如，对于基于游离DNA的肿瘤液体活检应用场景，BS转化对DNA的损伤会导致原始游离DNA分子的片段长度信息丢失、位置深度信息失真，从而限制了下游进行多组学生物信息分析和识别判断。
而新兴的酶学转化法，利用DNA去甲基化酶——DNA dioxidase（双加氧酶）TET家族蛋白，同样能够高效的将甲基化的胞嘧啶进行转换，同时又不会对DNA造成损伤，从而避免了BS转化的弊端，已逐渐替代BS转化法成为新的甲基化实验新标准。
近日，爱博泰克（ABclonal）与竹石生物（BamRock）签署战略合作协议，双方将利用各自技术优势、经验优势，共同推进酶转甲基化建库试剂的开发测试工作，力争为国内癌症早期检测企业、甲基化科研人员提供全新高标准的酶法甲基化建库全流程解决方案。
ABclonal
武汉爱博泰克生物科技有限公司（ABclonal Technology Co.,Ltd.）成立于2011年，作为生命科学解决方案的提供商，旨在为更多的科研工作者、IVD企业、新技术开发企业提供抗体、酶、NGS产品和蛋白制品等全套解决方案。
ABclonal现有波士顿抗体与蛋白研发中心、上海诊断与科研分子酶产品研发基地以及中国武汉光谷诊断与科研免疫产品生产和研发基地。经过多年的深耕与发展，ABclonal已拥有免疫与分子酶两大技术平台，集新型分子酶、全领域应用NGS建库解决方案、新平台单克隆抗体与高活性蛋白制品的研发与生产于一体。ABclonal致力成为产业科研转化的核心企业，向生命科学研究工作者和应用企业提供全套可靠的技术解决方案。
竹石生物BamRock
竹石生物科技（苏州）有限公司是一家以生物计算驱动，专注疾病诊断与治疗的生物科技公司。当前正致力将领先组学技术与深度学习技术相结合，聚焦于肿瘤早期检测技术的研发和临床应用。
竹石生物独家酶学甲基化建库技术NEEM-seq，可通过一次实验获取高质量多组学信息。结合深度神经网络，竹石生物开发出ctDNA单分子识别技术DeepTrace，已经成功发布首个肝癌早检临床级产品“甘晓宁”，助力肝癌高危/极高危人群更早发现癌症。
NEEM-seq是竹石生物通过自主创新、流程优化开发出的酶学甲基化建库技术，具有lambda转化率≥99.5%， puc19转化率≥99%的超高转化率，是竹石生物开展癌症早筛早诊研究和临床检测的底层核心技术之一。 ------------------------------------------------------------------------------
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发表于 2022-5-11 21:32:23
