我常常羡慕孩子眼中的二元世界,非黑即白,好人和坏人,美丽和丑陋,对事物的判断不会有丝毫犹豫。对于检测结果大多数也是二元的,阳性或阴性。可是成人的世界里哪有那么简单,弱阳性或者可疑的检测结果作为一种处于量子状态的比“薛定谔的猫”还神秘的阳性分分钟让检测人员怀疑人生。今天结合我的一些经验,跟大家一起分享一些弱阳性样品判读的原则。
一、排除污染和非特异扩增 本文讨论的所有前提都是建立在实验室处于一个正常受控的状态下,检测的各个环节都经过验证,检测结果准确可靠。
二、检测阳性结果的确认 严格按照试剂说明书和SOP操作,保证检测结果的准确性,这样即使出现弱阳性结果也可以确定是阳性,有条件的可以使用更精确的方法进行确认,如荧光定量PCR的结果可以使用数字PCR进行确证。 1拷贝模板的检测
三、评估检测系统的最低检测限 1.LOB、LOD和LOQ 每一个检测体系都有其固有的性能,因此需要使用标准物质或标准样品盘对检测系统进行评估,以确定其LOB、LOD和LOQ。对于qPCR和ELISA等定性方法需要LOB和LOD的评估,对于定量方法需要LOB、LOD和LOQ的评估。
LOB(Limit of blank), 空白检测限,指用空白样本去测试,在一定的概率下能测得的最高测量结果。
LOD(Limit of detection), 最低检测限,通常指对低浓度的分析物样本进行测试,在一定的概率的条件下能测得的最低值。
LOQ(Limit of quantitation), 定量限,通常指用低浓度的分析物样本进行测试得出的较低的值,这个值的准确性是有要求的,就是不光要能测到,而且还要保证结果是准确的。
当样品浓度低于LOB是无法检出的; 当样品浓度高于LOB而低于LOD,是无法稳定检出的,检出即为阳性; 当样品浓度高于LOD而低于LOQ,可稳定检出的,无法准确定量; 当样品浓度高于LOQ可精确定量。
2.核酸检测的LOD
3.血清学检测的LOD
四、确定检测样品中的病毒含量 检测就像用秤去秤东西,首先要知道秤的量程,最低就是LOD了,然后需要大致了解要称量的东西的大概重量,是棉花、木头还是钢材,非要用称钢材的秤去称少量的棉花那结果也一定是不准的,或者你明明把棉花放到秤上了但是显示是零。这就不是检测的问题而是试验设计的问题。
但是现实是我们检测实验室被要求必须用高性价比(便宜)的试剂盒去测每毫升几个拷贝的病毒,还要求我们给出明确的结果。所以才有了本文对弱阳性样品的强行判定。不同类型样品病原含量可以从文献、同行交流或者历史检测数据获得相关信息。 引自(Pan Y, et al. Viral load of SARS-CoV-2 in clinical samples.The Lancet Infectious diseases )
五、尽量一网打尽所有病原
对于核酸检测来说模板含量越低能检测到的概率就越低,因此LOD通常为95%的概率可以检出,但是我们遇到的情况是需要我们判定模板含量高于LOB而低于LOD的部分。 如下图,50微升的核酸中一共只有3个模板,如何能保证检测到模板?这其实是一个很不专业的问题,标准答案是如果我的试剂盒的LOD是200 copie/mL,样本中模板含量只有60 copie/mL,我当然检测不到了。
很不凑巧你的老板不懂专业,必须要你给出结果,样品中到底有没有模板?我的建议是多次采样检测和将每次50微升的核酸全部进行扩增,有2次检测为阳性基本可以确认样品中含有模板。
六、选择合适的试验策略 1.平行试验 Parallel test: 多个检测项目,只要有一个阳性即诊断为阳性,此法提高了敏感性,但降低了特异性,即减少漏诊率,提高了误诊率。当漏掉一个阳性后果严重时或再进行筛检费人力、物力时,要尽量减少漏诊率,则可采取平行试验。俗话说就是宁可错杀一千不放掉一个。但是当进行足够多的平行试验时,每份样品都是“阳性”。
2.序列试验 Serial test: 多个检测项目,必须全部为阳性才能诊断为阳性。此法可以提高特异性,降低了敏感性,即减少误诊率,但却增加了漏诊率,当误诊能造成严重后果,如不必要的、昂贵的或者有创治疗时,应该用序列试验。但是当进行足够多的序列试验时,每份样品都是“阴性”。
七、结合临床的实际情况
同时对同一宿主的不同部位(如鼻拭子、口腔拭子、全血、肛门拭子、精液等)采样检测; 过一段时间后进行采样复测; 结合同群动物的检测情况; 结合核酸检测和抗体检测结果; 技术手段和风险管理手段相结合。
小结:本文的一些内容有点违背检测的原则和科学规律,但是我们检测人又不得不面对和解决这样棘手的问题。希望本文能对有这方面困惑的同仁有所帮助。 ------------------------------------------------------------------------------ |