细胞因子风暴是机体免疫系统紊乱情况下,过度的细胞因子释放,导致机体免疫应答亢进,产生免疫病理。许多感染和自身免疫病中细胞因子风暴都可能作为严重的并发症,此次新冠病毒致死的重要原因之一也是细胞因子释放。临床病例显示,COVID-19重症患者往往表现典型的细胞因子释放综合征,过高的免疫应答,促炎因子高表达,但同时又伴随免疫功能失调,T细胞耗竭、血管渗漏等。具体的分子机制还鲜有报道,对于细胞因子风暴的成因值得深入探究。
近日,韩国科学技术院的一项研究为细胞因子风暴的成因提供了新的角度,研究发表在国际期刊Science Immunology,题为“Immunophenotyping of COVID-19 and influenza highlights the role of type I interferons in development of severe COVID-19 ”。 标题
研究者从健康人、COVID-19不同症状患者及流感重症患者中收集外周血单个核细胞(PBMC),利用单细胞RNA测序技术对不同患者细胞进行了系统性分析。根据标记基因聚类划分,最终鉴定了11类主要的免疫细胞类群。研究者将患者与正常人免疫细胞分布进行了比较,在流感和COVID-19重症患者中PBMC细胞类群都发生了明显的改变,COVID-19中经典单核细胞比例显著提高,而其他细胞相应减少。
COVID-19和流感免疫细胞类群
接着研究者比较了不同感染的影响,结果发现PBMC能够按疾病分组聚类,也就是在COVID-19病症特异性基因在各类免疫细胞中普遍改变,暗示可能由共同调节分子影响。尽管COVID-19与流感有很大差异,但是在单核细胞和DC细胞中有相似的转录标志基因,说明两种疾病在天然免疫应答水平有相同的信号通路。研究者基于转录组数据具体探究相关的信号通路,发现NFKB、IRF、CXCR在COVID-19不同病症特异性高表达,TNF、TGF等分子在流感和新冠肺炎中普遍高表达,因此在COVID-19中炎症相关分子有明显的激活。进一步根据细胞类型细致分析,发现CD8+ T细胞、NK细胞中NFKB1/2、JUN、TNF改变,而在单核、DC细胞中IL1B、NFKBID、OSM分子表达量变化。
COVID-19基因富集分析
由于CD8+ T细胞在病毒感染中的重要性,研究者重点关注了该细胞转录特征,首先分为效应记忆细胞和非效应记忆T细胞,其中1类细胞在流感中富集,而3类在COVID-19中富集,同时鉴定出其中上调的免疫应答分子。通过蛋白质互作和富集分析发现COVID-19中3类T细胞亚群TNF、IL-1信号通路高度活化。
CD8+T细胞亚群
接着研究者又分析了单核细胞的转录谱,与之前类似,TNF、IL-1在COVID-19中特异性上调,进一步将特异性基因分为亚类,富集分析发现COVID-19中主要是TNF/IL-1信号通路,而流感中则是I型干扰素通路激活,但在重症COVID-19中I型干扰素通路也起到了重要作用。为进一步分析干扰素信号通路的作用,研究者将轻症和重症COVID-19比较,结果表明多个干扰素刺激基因上调,TNF和IFN通路均有明显富集,血浆中IL-6、IL-18等炎性因子高表达。通过轨迹分析进一步证实了在重症患者中两条信号通路都活化,同时研究者分析了一个不响应IFN只与TNF有关的基因,通过表达模式推测IFN能够通过破坏TNF介导的免疫耐受负调节,增强TNF/NFKB通路,促进免疫反应高度活化。 单核细胞富集信号通路
为了证实研究中得到的结论,研究者利用RNA测序分析了COVID-19死亡患者肺部组织转录特征,结果证实了IFN和TNF通路活化的猜想。
肺部组织细胞及分子分析
该研究首次利用单细胞RNA测序技术系统性研究COVID-19重症患者免疫病理学,并通过转录特征和关键基因富集分析揭示了IFN和TNF在细胞因子风暴中的作用,揭示了干扰素通路在促进炎症发展中的重要作用,为细胞因子释放综合征的临床治疗提供了指导意义。
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