 首款适配体诊断试剂，上市在即！IVD原料厂家们，做好迎接适配体进入原料世界竞争的准备了吗？
2021年3月17日，英国约克和贝德福德郡：Aptamer Group今天宣布与快速诊断制造商Mologic建立商业合作关系。该合作伙伴关系将致力于为Aptamer Group的AptaDx SARS-CoV-2侧向快速测试提供CE注册。实验室样品的初步测试分析表明，其极好的灵敏度能够检测到每毫升低至1000的病毒颗粒，进一步临床验证正在英国纽卡斯尔东北的新冠肺炎综合中心进行，随后将进行CE注册。
与Mologic合作将有助于加速Aptamer Group的诊断产品向市场的发展，并通过Mologic为最终的商业化提供制造能力。Aptamer Group也正在与其他全球制造商进行讨论，获取更大的产能，期望可以达到每个月数百万个测试。 Aptamer Group的SARS-CoV-2 快速诊断试剂将是第一个基于适配体的商业化的产品。适配体基于核酸合成，与特异靶标有亲和力，通过固相合制备，易于扩大生产，具有高成本效益。与标准的基于蛋白质的试剂相比，适体的生产具有明显的成本优势，从而可以在全球范围内大规模开发和提供测试，包括向中低收入国家/地区提供。
小编咨询报价后发现，1g适配体，1万块钱，平均10元/mg，目前没有扩大生产的成本。
那么什么是核酸适配体呢？下面小编整理了它在IVD上的应用假设没有充分的理论依据，欢迎专家来拍砖。
1. 什么是核酸适配体
度娘解释：
核酸适配体（Aptamer）是一段寡核苷酸序列（DNA或RNA）。通常是利用体外筛选技术——指数富集的配体系统进化技术（Systematic evolution of ligands by exponential enrichment，SELEX），从核酸分子文库中得到的寡核苷酸片段。
- 度娘少讲了一个特征，核酸适配体都是单链的!
- 虽然也提RNA，但大家做的都是单链DNA，也就是ssDNA
- 双链DNA是双螺旋结构，单链DNA就自由了，它会凹出各种造型
- 凹出造型的DNA，有可能因为它的构象，正好结合某个小分子或蛋白。好比抗体的可变区。
- 同时它还是DNA，依然有核酸的属性。
2. 什么是SELEX
- 一个溶液里，有好多好多的不同的DNA序列
- 把靶蛋白放到这个溶液里，可以结合到这个蛋白上的DNA，都会吸附上去。
- 把这个蛋白留下，溶液丢掉
- 把蛋白上吸附的DNA洗脱，PCR扩增DNA
- 把这个蛋白再扔到扩增后的溶液，去结合可以被结合的DNA
- 把这个蛋白留下，溶液丢掉
- 如上重复N个循环
- 将蛋白上的DNA洗脱，高通量测序
- 得到的测序结果
- 序列A，占比5%
- 序列B，占比4%
- 。。。
占比最高的序列说明是被吸附，又被扩增最多的，这时就完成了SELEX
3. 鉴定核酸适配体
在SELEX产物的高通量测序后，能得到一系列可以吸附目标蛋白的DNA，但是它是不是特异的，不知道，得验证。很多DNA序列是渣男，见一个爱一个。必须剔除。通过反向蛋白去剔除非特异的DNA序列，只留下特异序列。
4. 用于IVD的基本设计方式
图片来自：DOI: 10.1039/c4an00132j
A：类似酶标，适配体包被在固相上，用于捕获靶蛋白
B：在适配体的两头接上荧光探针和淬灭探针，捕获靶蛋白，探针靠近，荧光淬灭
C：适配体上接荧光探针，另外补一个互补序列接淬灭探针，捕获靶蛋白，序列解离，荧光探针激活
D：一个适配体被截成两段，一段带荧光探针，另一段带淬灭探针，捕获靶蛋白，荧光淬灭
E：类似生化试剂，捕获靶蛋白，微球相互交联
F：石墨烯吸附适配体，探针处于淬灭状态，捕获靶蛋白，适配体从石墨烯释放，荧光探针激活
G：一个适配体被截成两段，各自偶联胶体金，捕获靶蛋白，胶体金微球靠近，颜色改变
H：A适配体被截成两段，接在B适配体两侧，B捕获靶蛋白激活A适配体，A适配体捕获MG,激活荧光。
5. 应用探讨
- 应用一，大分子蛋白的检测，纯粹代替抗体，但是适配体的亲和力没有比抗体要高，抗体更加稳定，适配体只能作为抗体的补充。但是适配体便宜，是不是可以在免疫生化试剂上进行替代？
- 应用二，小分子实现双抗检测，如果采用抗体检测小分子，只能用竞争法。可以用Aptamer代替一个抗体。
- 应用三，多个适配体包被制作核酸芯片，但是用来检测蛋白
- 应用四，与CRISP联用，适配体接上可以激活Cas12/13的DNA的杂交序列，当有靶蛋白时，解离启动Cas12/13的序列，Cas12/13开始发力
- 应用五，请你来后台补充~~
参考文献： 1.Aptamer-based biosensors for biomedical diagnostics， DOI: 10.1039/c4an00132j ------------------------------------------------------------------------------
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发表于 2021-3-22 22:33:29
